Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr2Q8C8T8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms