Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dclre1bQ8C7W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms