Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmo3Q8BZL8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo3Q8BZL8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo3Q8BZL8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms