Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc30Q8BVF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc30Q8BVF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc30Q8BVF4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc30Q8BVF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms