Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DseQ8BLI4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DseQ8BLI4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DseQ8BLI4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DseQ8BLI4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DseQ8BLI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DseQ8BLI4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DseQ8BLI4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DseQ8BLI4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DseQ8BLI4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms