Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnrc6bQ8BKI2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms