Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmd3Q8BHD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmd3Q8BHD4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms