Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8Q80YR6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8Q80YR6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms