Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc155Q80VJ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc155Q80VJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc155Q80VJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms