Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cand1Q6ZQ38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms