Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot1Q6ZQ08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms