Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sdk2Q6V4S5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdk2Q6V4S5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdk2Q6V4S5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms