Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja6Q6S5G4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja6Q6S5G4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms