Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx40Q6PE54 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1735.1 ms