Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt3Q6PE13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prrt3Q6PE13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrt3Q6PE13 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms