Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mfsd13aQ6PDE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mfsd13aQ6PDE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms