Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slf2Q6P9P0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Slf2Q6P9P0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slf2Q6P9P0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms