Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg2Q6NS82 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg2Q6NS82 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.5 ms