Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn12Q6JVL5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn12Q6JVL5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn12Q6JVL5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms