Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rftn1Q6A0D4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rftn1Q6A0D4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn1Q6A0D4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms