Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ric1Q69ZJ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ric1Q69ZJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ric1Q69ZJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms