Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk13Q69ZA1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cdk13Q69ZA1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cdk13Q69ZA1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms