Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptbn2Q68FG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms