Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp9cQ66X01 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9cQ66X01 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp9cQ66X01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms