Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrrc8eQ66JT1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms