Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt12Q64291 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt12Q64291 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms