Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim24Q64127 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim24Q64127 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim24Q64127 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms