Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f3Q63955 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms