Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa13Q62424 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa13Q62424 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms