Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptbn1Q62261 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn1Q62261 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn1Q62261 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms