Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itga6Q61739 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga6Q61739 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga6Q61739 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms