Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fscn1Q61553 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fscn1Q61553 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fscn1Q61553 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms