Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ecm1Q61508 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ecm1Q61508 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ecm1Q61508 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms