Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift88Q61371 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms