Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AcanQ61282 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AcanQ61282 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms