Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf4bQ61136 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4bQ61136 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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