Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cln3Q61124 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cln3Q61124 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cln3Q61124 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms