Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3Q60803 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Traf3Q60803 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf3Q60803 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3Q60803 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3Q60803 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3Q60803 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3Q60803 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3Q60803 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3Q60803 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms