Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc27a1Q60714 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a1Q60714 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms