Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm1Q60636 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm1Q60636 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm1Q60636 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms