Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms