Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc125Q5U465 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc125Q5U465 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc125Q5U465 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc125Q5U465 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms