Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms