Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mdc1Q5PSV9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mdc1Q5PSV9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mdc1Q5PSV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms