Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf1Q5ND28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf1Q5ND28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf1Q5ND28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms