Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1810065E05RikQ5NC41 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1810065E05RikQ5NC41 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms