Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp28Q5I043 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp28Q5I043 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp28Q5I043 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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