Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtl5Q5DTT4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtl5Q5DTT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rtl5Q5DTT4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms