Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q504N7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q504N7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q504N7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q504N7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q504N7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q504N7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q504N7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q504N7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q504N7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q504N7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q504N7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q504N7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q504N7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q504N7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q504N7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q504N7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q504N7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q504N7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q504N7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q504N7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q504N7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q504N7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q504N7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q504N7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q504N7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q504N7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q504N7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q504N7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q504N7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q504N7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q504N7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q504N7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q504N7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q504N7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q504N7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q504N7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms