Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otol1Q4ZJM7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otol1Q4ZJM7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms