Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xirp2Q4U4S6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Xirp2Q4U4S6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xirp2Q4U4S6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms